Cubatão teve origem junto ao Rio Mogi, na região denominada Piaçaguera, próximo de uma antiga trilha indígena que descia pelo vale do Rio Grande até o vale do Ururaí (Mogi), ligando-se também com o Vale do Paraíba. Foi por essa trilha que em 1532 João Ramalho teria descido, acompanhado pelos índios de Tibiriçá, para ajudar Martim Afonso de Souza, que pouco depois por ali seguiria até o Planalto.

Os historiadores acreditam que não seria possível encontrar vestígios do antigo caminho, devido à umidade da Serra do Mar e à rápida retomada do espaço pela floresta, quando a trilha foi abandonada devido aos ataques de índios hostis.

Em meados do século XX, com a criação do Polo Industrial de Cubatão, grandes mudanças voltaram a ocorrer, com alterações no curso dos rios e aproveitamento dos terrenos pelas indústrias, dificultando ainda mais precisar o local do antigo porto. Como ponto de referência, é citada a localização nas proximidades da antiga localização da estação ferroviária de Piaçaguera, depois transformada em pátio da siderúrgica Cosipa/Usiminas:

Tela de Benedito Calixto (parcialmente reproduzida) recria a cena do desembarque do colonizador Martim Afonso de Souza ao porto de Piaçaguera, em outubro de 1532, no caminho para o planalto paulista
Imagem: enciclopédia Grandes Personagens da Nossa História, Ed. Abril Cultural, São Paulo, 1969

Pátio de Piaçaguera, com a estação e o rio no canto direito da imagem, em antigo cartão postal
Imagem: acervo do professor e pesquisador santista Francisco Carballa

Aproximações sucessivas de imagem por satélite feita em 2012 mostram (com uma seta branca) o local da atual estação ferroviária de Piaçaguera, alguns metros distante da antiga, junto ao Rio Piaçaguera, sendo assim o local descrito como da criação do Porto de Piaçaguera

Vista por satélite em 2012 do local da foto em preto-e-branco acima
Imagens: Google Maps, 2012 (acesso em 15/11/2012)

Mapa da região, com o centro de Cubatão à esquerda e o canal de Piaçaguera à direita. Acima dele, a seta branca próxima à rodovia SP-055  indica o local da estação ferroviária e, por aproximação, do Porto de Piaçaguera
Imagens: Gogle Maps, 2012 (acesso em 15/11/2012)